Le groupe CFF comprend quatre divisions: Voyageurs, CFF Cargo, (Marchandises), Infrastructure et Immobilier. A celles-ci viennent s’ajouter les fonctions de pilotage et de service, dont font partie notamment les secteurs des finances et de la gestion du personnel.

La Direction du groupe fixe des objectifs et des axes stratégiques annuels pour chaque entité de l’entreprise.